奶粉加工工藝是一個很漫長的過程，需要經過600多次的檢測，并且要經歷生乳采購、過濾雜質、加熱殺菌、成分調整、濃縮、噴霧干燥和包裝等工藝。新政出臺后現代嬰幼兒奶粉的加工工藝更加嚴謹，在生產過程中需要添加乳清蛋白粉、乳糖、DHA、核苷酸、維生素和礦物質等營養成分，使之更接近母乳，滿足嬰幼兒健康成長的需要。
奶粉制作工藝
最早的奶粉加工工藝誕生于1832年，俄羅斯化學家M.Dirchoff首次對奶粉進行批量生產，生產步驟先是使用真空蒸發管把奶粉濃縮成餅，接著干燥制粉或者將經過濃縮后的牛奶攤在加熱的滾筒壁上，待牛奶干燥后再從滾筒上刮下來，這就是最傳統的滾筒干燥法。
目前奶粉生產大多數是采用噴霧干燥法，將原料乳預熱殺菌消毒后，利用真空濃縮鍋或真空蒸發器立即濃縮形成原乳，濃縮到原體積的1/4左右，然后經離心泵極細的噴口噴出，同時噴頭高速旋轉、過濾，在溫度達130℃到160℃的空氣中，牛奶液直接交換瞬間完成蒸發，干燥，變成粉末，然后迅速出粉，接著分篩并降溫到30℃冷卻，檢測，稱重，分裝，然后就是裝罐了。相比滾筒干燥法，噴霧干燥法能更多地保存牛奶的營養。牛奶變成奶粉這一漫長的產業鏈中，任何一個環節監管不力，工藝設備落后，都有可能導致奶粉的質量和安全問題。
在鮮奶驗收環節，原料奶的營養指標、衛生指標和質量控制措施非常重要。南慶賢說，比如說牛體和牛場的衛生問題管理，飼料的營養和安全，擠奶設施的清潔消毒，規范擠奶等等，都是掛一漏萬的環節。擠奶完用凈乳機除雜后，需要及時冷卻降溫，避免微生物在牛奶中繁殖，造成原奶腐敗。鮮奶的儲存時間不可能過長，以免嗜冷菌大量繁殖，分解蛋白質。
隨后是在乳品加工廠的配料，配料工序非常容易引起質量和安全問題：輔料衛生質量(在運輸、貯藏中因防護不當，受到細菌、霉菌及鼠蟲污染，產生毒素、致病菌，對人體產生危害);營養素過量(一些微量元素、脂溶性維生素含量超標可能對人體產生危害);輔料融化效果(如果溶解不徹底則在后續的過濾和凈乳中被甩出，影響產品營養指標)。
因為油水分離的物理特性，在均質化過程中，需要防止脂肪上浮、防止奶粉中脂肪分子游離到顆粒表面。而經過冷卻、暫存后，在殺菌、濃縮工序容易出現的質量問題有：殺菌不徹底造成濃奶細菌總數過高，導致最終產品微生物超標;設備清洗不徹底，污染產品;設備故障，如物料泵冷卻密封水漏進奶中、加熱蒸汽漏進奶中等，均易導致產品大腸菌和雜質超標;奶濃度低，導致奶粉顆粒小，影響沖調性。高溫殺毒、清洗后，需要進行噴霧干燥，接粉、篩粉、貯粉、包裝、設備清洗等最后的環節。
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