MES系統質量管理將從以事后檢查與糾正為主的模式向以事前預防與控制為主的模式轉化。同時立足于給企業不同的決策需要提供支持信息，所涉及的信息將不僅僅是歷史數據，更重要的是企業有關質量控制的決策信息。
MES系統質量管理模塊
MES系統質量信息管理將以網絡和數據庫為基礎，建立各種質量評價、分析和決策系統。同時隨著專家智能系統理論的不斷完善，質量管理系統就可以實現自動化的決策和控制。利用這樣的系統，就能從全局出發，分析和處理所有信息，綜合評價質量和系統功能，從而大大提高企業質量水平。
正是在上述質量管理模式的發展趨勢的指導下，計算機集成質量管理系統在三個方面進行集成：
質量管理涉及零件制造過程質量信息的采集、反饋、控制，同時又涉及到上層的質量問題決策。執行層的檢測與過程監控的有關信息應能及時的傳遞到管理層，質量計劃、監測計劃、質量控制任務等應能夠及時地傳遞到管理層和執行層。
集成質量系統與CIMS的其他自動化系統有機集成：
1)與APP系統集成。集成質量系統從CAD系統獲得自動質量檢測和產品試實驗所需的產品質量范圍及有關的產品及零件信息，對工序能力及產品實際質量狀況進行分析，分析結果反饋給產品設計、過程設計部門。
2)與MES系統集成。自動化制造過程應用產品和過程的質量信息進行現場的工序質量控制，對制造過程進行相應調整并預防次品的產生。同時，不合格品的識別和診斷也為制造過程的改進提供依據。
3)與ERP系統集成。集成質量系統及時的將有關質量信息反饋給生產管理系統，以便及時調整生產調度計劃和物料需求計劃。同時，集成質量系統反饋出來的外購件、外協件的質量信息是制造資源計劃中進貨商、供貨商評價的一個重要信息來源，質量成本、質量性能指標信息是企業經營決策支持系統的重要信息組成。
過程集成指產品生命周期各個階段質量信息的集成，即市場到調研、制造到使用各個階段的集成。MES系統在質量管理中的作用質量管理是MES系統中的一個核心模塊，質量管理在MES中的運用，使得企業的產品質量管理提升到一個新的階段。
在傳統制造模式和質量理念的驅使和約束下，我國企業的質量管理通常僅限于質量管理部門的獨立活動，質量保證體系條塊分割，各部門、各環節的質量管理活動相對封閉和分散，單純以滿足產品設計規范為目標，注重質量問題的事后處理，難以實現對產品制造過程整體質量水平的控制。傳統的質量保證技術與手段已難以適應現代質量保證的要求，采用MES與質量管理相結合的手段，可以優化傳統質量管理所存在的問題。
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