MES系統無論從功能模型還是信息模型以及相關技術上，都覆蓋了流程生產行業和離散制造行業。但是，無論從工藝流程還是生產組織方式方面，流程生產行業和離散制造行業都存在較大的差別。
水泥MES系統
針對流程生產行業，在MES系統具體實施上與傳統離散行業存在著很大的差異。具體表現在行業的需求差異、產品結構、工藝流程、自動化水平、生產計劃管理、機器設備、物料管理、批號管理和跟蹤等幾個方面。
流程生產企業與離散制造企業之間的差異，導致MES系統在面向流程行業的應用中有以下特點:
1.流程行業的生產過程包含復雜的物理、化學過程，工藝機理復雜，加工單元相互影響，具有眾多不確定性。因此，操作管理是流程行業MES系統的一項重要任務。MES系統負責監督所執行的每一項操作要遵守操作步驟和規范，在連續、混合及間歇生產環境下為操作員提供流程啟動、平穩運行及停機等過程的標準操作指令。
2.鑒于流程行業大規模、高產能、高能耗和重污染的特點，流程行業MES的調度決策功能需要對物料和能量提供最佳控制策略，不僅以提高生產效率降低生產成本為目標，還應將節省能源、減少污染等目標考慮在內。
3.流程行業兼有流程和離散的特點，因此MES系統在決策過程中，不僅需要考慮連續過程變量，也要考慮離散過程變量。為對生產過程及產品質量進行控制，必須建立反映連續過程主要物理、化學變化過程的過程模擬模型，并將過程模型與優化模型結合起來。
綜合以上特點，流程行業MES系統的目標是，在獲取生產流程所需全部信息的基礎上，將分散的控制系統、生產調度系統和管理決策系統等有機地集成起來，綜合運用自動化技術、信息技術、計算機技術、生產加工技術和現代管理科學，從生產過程的全局出發，通過對生產活動所需的各種信息的集成，集監測、控制、優化、調度、管理、經營、決策于一體，形成一個能適應各種生產環境和市場需求的總體最優的高質量、高效益、高柔性的現代化企業綜合自動化系統，以達到提高企業經濟效益、適應能力和競爭能力的目的。針對流程行業的特點，MES系統應采用開放性的、柔性的、可擴展的、模塊化的體系結構。
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